供奉肉身菩萨为九华山寺院独有。自唐以来，九华山自然形成了16尊肉身菩萨，现有6尊可供观瞻。
其中明代无瑕和尚肉身被崇祯皇帝敕封为“应身菩萨”。
1999年1月发现的仁义师太肉身是世界上唯一的比丘尼肉身。
九华山佛教供奉肉身为汉传佛教特殊现象，史称“肉身菩萨”、“全身舍利”。
肉身菩萨是高僧圆寂后通过特殊处理长期保存真身真容以示敬仰。
现开放观瞻两处肉身菩萨宝殿：
月氏宝殿（肉身宝殿）：供奉着地藏王菩萨肉身舍利；
百岁宫：供奉着明代无瑕和尚的肉身舍利。
九华山肉身菩萨是善男信女朝拜观瞻必去之地，亲眼目睹得道高僧坐化的真容。
2、化城寺
九华山的开山祖庭，现存明清建筑群，寺内藏有明万历皇帝圣旨、血经、贝叶经等佛门至宝，寺前放生池月夜倒影如画。
3、衹园寺
规模宏大，九华山四大丛林之一，建于明代，大雄宝殿供奉五世佛。
九华山里寺庙众多，沿九华街一路走过去依次有衹园寺、化城寺等国保级重点寺庙。游人可选择有代表性的著名寺院参拜观赏。
老年游客如不能坐缆车和徒步登山，就在九华街这一片核心区域参观一下寺院，坐观光车到站点下车欣赏一下壮丽清幽山色也挺不错的。
