1、秦始皇帝陵博物院（陕西西安）
依托秦始皇陵，由兵马俑博物馆与丽山园组成，世界文化遗产、国家一级博物馆，完整呈现秦代帝陵规制与军阵文明。
2、三星堆博物馆（四川广汉）
依托三星堆古蜀遗址，西南地区最大遗址类单体博物馆；新馆2023年7月开放，展出文物1500余件/套，镇馆之宝含青铜神树、黄金面具。
3、殷墟遗址博物馆（河南安阳）
毗邻殷墟核心区，2024年2月开放，总建筑面积5.1万平方米，展陈文物近4000件/套，国内首个全景式展示商文明的国家重大专题馆。
4、二里头夏都遗址博物馆（河南洛阳）
2019年开放，国家重大文化工程，依托“华夏第一王都”二里头遗址，集中展示夏代文明与中华文明探源工程成果。
5、金沙遗址博物馆（四川成都）
继三星堆后的古蜀文化又一中心，镇馆之宝“太阳神鸟”金饰为中国文化遗产标志，再现古代蜀国祭祀与生活图景。
6、良渚博物院（浙江杭州）
依托良渚古城遗址（世界文化遗产），系统展示中华五千多年文明史，玉琮、玉璧为核心重器，反映早期国家与礼制。
7、周口店北京人遗址博物馆（北京房山）
世界文化遗产，旧石器时代核心遗址，展示北京猿人、山顶洞人化石与遗存，人类演化重要地标。
8、汉景帝阳陵博物院（陕西咸阳）
汉景帝刘启陵园，中国首座全地下遗址博物馆，完整呈现汉代帝陵陪葬制度与陶俑军阵。
9、海昏侯国遗址博物馆（江西南昌）
2020年开放，依托西汉海昏侯刘贺墓遗址，出土金器、竹简、青铜器等超1万件，汉代高等级墓葬典范。
10、南越王博物院（王墓展区）（广东广州）
依托南越王赵眜墓，国家一级博物馆，出土丝缕玉衣、文帝行玺金印，见证岭南秦汉融合史。
11、西安半坡博物馆（陕西西安）
中国第一座史前遗址博物馆，仰韶文化半坡类型命名地，代表文物为人面鱼纹彩陶盆，揭示六千年前聚落形态。
12、马王堆汉墓陈列（湖南博物院·湖南长沙）
依托西汉利苍家族墓，出土文物3000余件，含辛追夫人遗体、T型帛画等，为汉初文明核心实证（注：属遗址文物入藏陈列，非原址博物馆）。
