华藏寺是一个比较常见的寺名，“华藏寺”地名中的“华藏”，源自佛教语，是“莲华藏世界”的略称。“华”通“花”，特指莲花，寓意着华藏世界如莲花般清净、美好、庄严，“藏”指宝藏，寓意着此世界中蕴含无量珍宝、功德和智慧。
昆山、无锡、峨眉山等地都有华藏寺，它们有着各自不同的故事。昆山华藏寺由慧聚寺子院演变而来，慧聚寺建于梁代天监十年（公元511年），开山祖师慧向是梁武帝萧衍之师。相传慧向初来昆山时，想建精舍却未能如愿，当夜风雨暴作，次日黎明殿基和台阶基石竟已砌就，传说是山神相助。北宋宣和间，慧聚寺子院改建为十方贤者讲寺，并易名为“华藏讲寺”。该寺历经多次重建和改建，1992年昆山市人民政府批准重建华藏寺，2004年6月5日举行开光庆典。
无锡华藏寺建于南宋绍兴二十四年（公元1154年），是为了每年祭祀太师张俊，在其墓左侧建造的寺院，赐名“华藏褒忠显亲禅寺”。张俊原本与岳飞同为中兴四将，后期贪财媚上，与岳飞政见、人品相悖。他是岳飞案唯一军方参与的大将，诬告岳飞部将张宪谋反，伪造证据，牵出岳飞父子；拉拢岳飞旧部王俊诬告，构织“谋反”罪状核心链条；主持会审，严刑逼供，坐实冤狱，是岳飞案关键证人与审讯者，其参与彻底坐实岳飞“谋逆”假象，让冤狱更具迷惑性。
张俊害死岳飞（1142年）后还活了12年，他全程未受任何惩罚，反而备受宋高宗宠信，封清河郡王，晚年极尽奢靡，富贵善终。他死后追封循王，谥号“忠烈”，高宗亲题碑额，哀荣备至，后世唾骂他，西湖岳王庙前铸其跪像，永世陪罪。
相传寺中有个烧火和尚阿弥，忠厚勤奋。一日，他照顾一位病丐，病丐死后，阿弥背驮其出山门时竟腾空而起，升入云端。僧众皆呼“阿弥驮佛”，后人误读为“阿弥陀佛”。
峨眉山华藏寺全称为“永明华藏寺”，位于峨眉山金顶主峰，海拔高度3077米，是中国海拔最高的汉传寺院。明洪武初，国师宝昙奉旨来山重修寺院，因山高风大，云南总兵祁三升捐资，将之覆为铁瓦，俗称铁瓦殿。明万历年间，妙峰、惟密禅师发愿铸三大士渗金像，募得黄金数千两，铸造铜殿，明神宗御题横额称“永明华藏寺”。该寺历经多次火灾，2002年开始重建，2006年6月18日举行了落成典礼和十方普贤像开光仪式。
